Στο μικρό νησί, που δεσπόζει πίσω από το λιμάνι στην κατάληξη ενός δεύτερου μώλου, βρίσκεται και ο Πύργος Τζανετάκη, ένα από τα σημαντικότερα μνημεία της πόλης. Ο πύργος χτίστηκε το 1829 από την οικογένεια Τζανετάκη – Γρηγοράκη και αποτελεί ένα από τα εντυπωσιακότερα πυργόσπιτα της ευρύτερης περιοχής. Από το 1989, ο Πύργος Τζανετάκη στεγάζει το Ιστορικό – Εθνολογικό Μουσείο της Μάνης.
Το 1770 οι καπεταναίοι του Μαραθονησίου, πήραν μέρος στα Ορλωφικά και το 1780 οι Τούρκοι αποκεφάλισαν τον Έξαρχο Γρηγοράκη. Ο Τζανέτμπεης Γρηγοράκης υπήρξε από τους πιο αξιόλογους Μπέηδες της Μάνης και επί της ηγεμονίας του, το Μαραθονήσι γνώρισε λαμπρές ημέρες δόξης.
Σήμερα στο Μαραθονήσι δεσπόζει με την παρουσία του ο παραδοσιακός Πύργος του Τζανετάκη Γρηγοράκη που αντανακλά την αίγλη της εποχής του. Έξω του Πύργου υπήρχε ανάγλυφη παράσταση της Ελευθερίας που ο Γρηγοράκης δώρισε στο Μεγ. Ναπολέοντα. Στον Πύργο λειτουργεί Ιστορικό και Εθνολογικό Μουσείο με Μανιάτικα εκθέματα.